Forschung
ZPM-Registerstudie
Das Ziel der Personalisierten Medizin ist es, durch eine verbesserte Diagnose von Erkrankungen zu zielgerichteten, nebenwirkungsarmen Therapien zu gelangen und für jede Patientin und jeden Patienten eine optimierte Behandlungsstrategie zu finden.
Eine aktuelle Herausforderung im Gesundheitswesen besteht darin, neue Ergebnisse aus der personalisierten Medizin zeitnah in Studien und die klinische Routineversorgung der Patientinnen und Patienten zu überführen. Um den Erkenntnisgewinn bzw. die Evidenzgenerierung effizient in personalisierten Behandlungsansätze zu überführen, sind eine gemeinsame, harmonisierte und standortübergreifende Sammlung, Verknüpfung und Auswertung der molekularen und klinischen Daten notwendig. Hierfür wurde das ZPM Heidelberg wie die anderen ZPMs in BW (Freiburg, Tübingen, Ulm) als Registerstudie aufgebaut, um standortübergreifend einen geschützten Datenaustausch über die baden-württembergische “bwHealthCloud” und in Zukunft über die deutschlandweite Datenintegartionsplattform “dnpm:DIP” zu ermöglichen. Auf diese Weise sollen vor allem Behandler und Forscher in verschiedenen Institutionen effizienter miteinander vernetzt werden und die diagnostischen und Behandlungsdaten für eine bessere zukünftige Entscheidungsfindung bereit stehen. Dies dient auch der besseren Erforschung und Qualitätssicherung der Diagnostik und Behandlung im Rahmen der Personalisierten Medizin.
In dem Register werden Daten zu Erkrankungs- und Therapieverlauf, medizinische und wissenschaftliche Befunde, Therapieempfehlungen und die Umsetzung sowie eventuelle Nebenwirkungen und der klinische Erfolg der Behandlung im Verlauf standardisiert dokumentiert. Die Daten werden pseudonymisiert und sicher an den Zentren für Personalisierte Medizin zur Vorbereitung auf die MTBs und im Rahmen von Qualitätssicherungsmaßnahmen sowie Forschungsprojekten regelmäßig ausgewertet.
Mit der Zustimmung der Patientinnen und Patienten, ihre Daten für die Forschung zur Verfügung zu stellen, helfen sie die Personalisierte Medizin weiterzuentwickeln, sodass zukünftig noch mehr Betroffene von einer zielgerichteten Behandlung profitieren können.
Publikationen (Auswahl)
2024
Präzisionsonkologie und molekulare Tumorboards. Mack E; Horak P; Fröhling S; Neubauer A (2024). In Innere Medizin (Heidelberg, Germany) 65 (5). DOI: 10.1007/s00108-024-01689-0.
Leveraging Off-Target Reads in Panel Sequencing for Homologous Recombination Repair Deficiency Screening in Tumor. Ball M; Ourailidis I; Kluck K; Menzel M; Kirchner M; Allgäuer M; Tay TKY; Schnecko F; Volckmar A-L; Goldschmid H; Neuman O; Fröhling S; Schirmacher P; Budczies J; Stenzinger A; Kazdal D (2024). In The Journal of molecular diagnostics : JMD 26 (6). DOI: 10.1016/j.jmoldx.2024.02.008.
2023
Multicentric pilot study to standardize clinical whole exome sequencing (WES) for cancer patients. Menzel M; Ossowski S; Kral S; Metzger P; Horak P; Marienfeld R; Boerries M; Wolter S; Ball M; Neumann O; Armeanu-Ebinger S; Schroeder C; Matysiak U; Goldschmid H; Schipperges V; Fürstberger A; Allgäuer M; Eberhardt T; Niewöhner J; Blaumeiser A; Ploeger C; Haack TB; Tay TKY; Kelemen O; Pauli T; Kirchner M; Kluck K; Ott A; Renner M; Admard J; Gschwind A; Lassmann S; Kestler H; Fend F; Illert AL; Werner M; Möller P; Seufferlein TTW; Malek N; Schirmacher P; Fröhling S; Kazdal D; Budczies J; Stenzinger A (2023). In NPJ precision oncology 7 (1). DOI: 10.1038/s41698-023-00457-x.
Real-world data for precision cancer medicine-A European perspective. Christopoulos P; Schlenk R; Kazdal D; Blasi M; Lennerz J; Shah R; Budczies J; Malek N; Fröhling S; Rosenquist R; Schirmacher P; Bozorgmehr F; Kuon J; Reck M; Thomas M; Stenzinger A (2023). In Genes, chromosomes & cancer 62 (9). DOI: 10.1002/gcc.23135.
The German Network for Personalized Medicine to enhance patient care and translational research. Illert AL; Stenzinger A; Bitzer M; Horak P; Gaidzik VI; Möller Y; Beha J; Öner Ö; Schmitt F; Laßmann S; Ossowski S; Schaaf CP; Hallek M; Brümmendorf TH; Albers P; Fehm T; Brossart P; Glimm H; Schadendorf D; Bleckmann A; Brandts CH; Esposito I; Mack E; Peters C; Bokemeyer C; Fröhling S; Kindler T; Algül H; Heinemann V; Döhner H; Bargou R; Ellenrieder V; Hillemanns P; Lordick F; Hochhaus A; Beckmann MW; Pukrop T; Trepel M; Sundmacher L; Wesselmann S; Nettekoven G; Kohlhuber F; Heinze O; Budczies J; Werner M; Nikolaou K; Beer AJ; Tabatabai G; Weichert W; Keilholz U; Boerries M; Kohlbacher O; Duyster J; Thimme R; Seufferlein T; Schirmacher P; Malek NP (2023). In Nature medicine 29 (6). DOI: 10.1038/s41591-023-02354-z.
Accurate tumor purity determination is critical for the analysis of homologous recombination deficiency (HRD). Menzel M; Endris V; Schwab C; Kluck K; Neumann O; Beck S; Ball M; Schaaf C; Fröhling S; Lichtner P; Schirmacher P; Kazdal D; Stenzinger A; Budczies J (2023). In Translational oncology 35. DOI: 10.1016/j.tranon.2023.101706.
Homogenous TP53mut-associated tumor biology across mutation and cancer types revealed by transcriptome analysis. Romanovsky E; Kluck K; Ourailidis I; Menzel M; Beck S; Ball M; Kazdal D; Christopoulos P; Schirmacher P; Stiewe T; Stenzinger A; Budczies J (2023). In Cell death discovery 9 (1). DOI: 10.1038/s41420-023-01413-1.
Analysis of rare fusions in NSCLC: Genomic architecture and clinical implications. Seker-Cin H; Tay TKY; Kazdal D; Kluck K; Ball M; Neumann O; Winter H; Herth F; Heußel C-P; Savai R; Schirmacher P; Thomas M; Budczies J; Allgäuer M; Christopoulos P; Stenzinger A; Volckmar A-L (2023). In Lung cancer (Amsterdam, Netherlands) 184. DOI: 10.1016/j.lungcan.2023.107317.
Implementation of precision medicine in healthcare-A European perspective. Stenzinger A; Moltzen EK; Winkler E; Molnar-Gabor F; Malek N; Costescu A; Jensen BN; Nowak F; Pinto C; Ottersen OP; Schirmacher P; Nordborg J; Seufferlein T; Fröhling S; Edsjö A; Garcia-Foncillas J; Normanno N; Lundgren B; Friedman M; Bolanos N; Tatton-Brown K; Hill S; Rosenquist R (2023). In Journal of internal medicine. DOI: 10.1111/joim.13698.
2022
Deciphering the immunosuppressive tumor microenvironment in ALK- and EGFR-positive lung adenocarcinoma. Budczies J; Kirchner M; Kluck K; Kazdal D; Glade J; Allgäuer M; Kriegsmann M; Heußel C-P; Herth FJ; Winter H; Meister M; Muley T; Goldmann T; Fröhling S; Wermke M; Waller CF; Tufman A; Reck M; Peters S; Schirmacher P; Thomas M; Christopoulos P; Stenzinger A (2022). In Cancer immunology, immunotherapy : CII 71 (2). DOI: 10.1007/s00262-021-02981-w.
Homologous recombination deficiency is inversely correlated with microsatellite instability and identifies immunologically cold tumors in most cancer types. Budczies J; Kluck K; Beck S; Ourailidis I; Allgäuer M; Menzel M; Kazdal D; Perkhofer L; Kleger A; Schirmacher P; Seufferlein T; Stenzinger A (2022). In The journal of pathology. Clinical research 8 (4). DOI: 10.1002/cjp2.271.
Gene expression-based prediction of pazopanib efficacy in sarcoma. Heilig CE; Laßmann A; Mughal SS; Mock A; Pirmann S; Teleanu V; Renner M; Andresen C; Köhler BC; Aybey B; Bauer S; Siveke JT; Hamacher R; Folprecht G; Richter S; Schröck E; Brandts CH; Ahrens M; Hohenberger P; Egerer G; Kindler T; Boerries M; Illert AL; Bubnoff N von; Apostolidis L; Jost PJ; Westphalen CB; Weichert W; Keilholz U; Klauschen F; Beck K; Winter U; Richter D; Möhrmann L; Bitzer M; Schulze-Osthoff K; Brors B; Mechtersheimer G; Kreutzfeldt S; Heining C; Lipka DB; Stenzinger A; Schlenk RF; Horak P; Glimm H; Hübschmann D; Fröhling S (2022). In European journal of cancer (Oxford, England : 1990) 172. DOI: 10.1016/j.ejca.2022.05.025.
Standards for the classification of pathogenicity of somatic variants in cancer (oncogenicity): Joint recommendations of Clinical Genome Resource (ClinGen), Cancer Genomics Consortium (CGC), and Variant Interpretation for Cancer Consortium (VICC). Horak P; Griffith M; Danos AM; Pitel BA; Madhavan S; Liu X; Chow C; Williams H; Carmody L; Barrow-Laing L; Rieke D; Kreutzfeldt S; Stenzinger A; Tamborero D; Benary M; Rajagopal PS; Ida CM; Lesmana H; Satgunaseelan L; Merker JD; Tolstorukov MY; Campregher PV; Warner JL; Rao S; Natesan M; Shen H; Venstrom J; Roy S; Tao K; Kanagal-Shamanna R; Xu X; Ritter DI; Pagel K; Krysiak K; Dubuc A; Akkari YM; Li XS; Lee J; King I; Raca G; Wagner AH; Li MM; Plon SE; Kulkarni S; Griffith OL; Chakravarty D; Sonkin D (2022). In Genetics in medicine : official journal of the American College of Medical Genetics 24 (5). DOI: 10.1016/j.gim.2022.01.001.
Assigning evidence to actionability: An introduction to variant interpretation in precision cancer medicine. Horak P; Leichsenring J; Goldschmid H; Kreutzfeldt S; Kazdal D; Teleanu V; Endris V; Gieldon L; Allgäuer M; Volckmar A-L; Dikow N; Renner M; Kirchner M; Penzel R; Ploeger C; Brandt R; Seker-Cin H; Budczies J; Heilig CE; Neumann O; Schaaf CP; Schirmacher P; Fröhling S; Stenzinger A (2022). In Genes, chromosomes & cancer 61 (6). DOI: 10.1002/gcc.22987.
Comprehensive cancer predisposition testing within the prospective MASTER trial identifies hereditary cancer patients and supports treatment decisions for rare cancers. Jahn A; Rump A; Widmann TJ; Heining C; Horak P; Hutter B; Paramasivam N; Uhrig S; Gieldon L; Drukewitz S; Kübler A; Bermudez M; Hackmann K; Porrmann J; Wagner J; Arlt M; Franke M; Fischer J; Kowalzyk Z; William D; Weth V; Oster S; Fröhlich M; Hüllein J; Valle González C; Kreutzfeldt S; Mock A; Heilig CE; Lipka DB; Möhrmann L; Hanf D; Oleś M; Teleanu V; Allgäuer M; Ruhnke L; Kutz O; Knurr A; Laßmann A; Endris V; Neumann O; Penzel R; Beck K; Richter D; Winter U; Wolf S; Pfütze K; Geörg C; Meißburger B; Buchhalter I; Augustin M; Aulitzky WE; Hohenberger P; Kroiss M; Schirmacher P; Schlenk RF; Keilholz U; Klauschen F; Folprecht G; Bauer S; Siveke JT; Brandts CH; Kindler T; Boerries M; Illert AL; Bubnoff N von; Jost PJ; Metzeler KH; Bitzer M; Schulze-Osthoff K; Kalle C von; Brors B; Stenzinger A; Weichert W; Hübschmann D; Fröhling S; Glimm H; Schröck E; Klink B (2022). In Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology 33 (11). DOI: 10.1016/j.annonc.2022.07.008.
Genomic architecture of FGFR2 fusions in cholangiocarcinoma and its implication for molecular testing. Neumann O; Burn TC; Allgäuer M; Ball M; Kirchner M; Albrecht T; Volckmar A-L; Beck S; Endris V; Goldschmid H; Lehmann U; Seker-Cin H; Uhrig S; Roessler S; Budczies J; Fröhling S; Longerich T; Wagner AH; Vogel A; Schirmacher P; Stenzinger A; Kazdal D (2022). In British journal of cancer 127 (8). DOI: 10.1038/s41416-022-01908-1.
Pan-cancer analysis of genomic scar patterns caused by homologous repair deficiency (HRD). Rempel E; Kluck K; Beck S; Ourailidis I; Kazdal D; Neumann O; Volckmar AL; Kirchner M; Goldschmid H; Pfarr N; Weichert W; Hübschmann D; Fröhling S; Sutter C; Schaaf CP; Schirmacher P; Endris V; Stenzinger A; Budczies J (2022). In NPJ precision oncology 6 (1). DOI: 10.1038/s41698-022-00276-6.
Trailblazing precision medicine in Europe: A joint view by Genomic Medicine Sweden and the Centers for Personalized Medicine, ZPM, in Germany. Stenzinger A; Edsjö A; Ploeger C; Friedman M; Fröhling S; Wirta V; Seufferlein T; Botling J; Duyster J; Akhras M; Thimme R; Fioretos T; Bitzer M; Cavelier L; Schirmacher P; Malek N; Rosenquist R (2022). In Seminars in cancer biology 84. DOI: 10.1016/j.semcancer.2021.05.026.
Precision oncology for intrahepatic cholangiocarcinoma in clinical practice. Tomczak A; Springfeld C; Dill MT; Chang D-H; Kazdal D; Wagner U; Mehrabi A; Brockschmidt A; Luedde T; Naumann P; Stenzinger A; Schirmacher P; Longerich T (2022). In British journal of cancer 127 (9). DOI: 10.1038/s41416-022-01932-1.
2021
A gene expression signature associated with B cells predicts benefit from immune checkpoint blockade in lung adenocarcinoma. Budczies J; Kirchner M; Kluck K; Kazdal D; Glade J; Allgäuer M; Kriegsmann M; Heußel C-P; Herth FJ; Winter H; Meister M; Muley T; Fröhling S; Peters S; Seliger B; Schirmacher P; Thomas M; Christopoulos P; Stenzinger A (2021). In Oncoimmunology 10 (1). DOI: 10.1080/2162402X.2020.1860586.
Comprehensive Genomic and Transcriptomic Analysis for Guiding Therapeutic Decisions in Patients with Rare Cancers. Horak P; Heining C; Kreutzfeldt S; Hutter B; Mock A; Hüllein J; Fröhlich M; Uhrig S; Jahn A; Rump A; Gieldon L; Möhrmann L; Hanf D; Teleanu V; Heilig CE; Lipka DB; Allgäuer M; Ruhnke L; Laßmann A; Endris V; Neumann O; Penzel R; Beck K; Richter D; Winter U; Wolf S; Pfütze K; Geörg C; Meißburger B; Buchhalter I; Augustin M; Aulitzky WE; Hohenberger P; Kroiss M; Schirmacher P; Schlenk RF; Keilholz U; Klauschen F; Folprecht G; Bauer S; Siveke JT; Brandts CH; Kindler T; Boerries M; Illert AL; Bubnoff N von; Jost PJ; Spiekermann K; Bitzer M; Schulze-Osthoff K; Kalle C von; Klink B; Brors B; Stenzinger A; Schröck E; Hübschmann D; Weichert W; Glimm H; Fröhling S (2021). In Cancer discovery 11 (11). DOI: 10.1158/2159-8290.CD-21-0126.
Erratum zu: Varianteninterpretation in dermolekularen Pathologie und Onkologie. Horak P; Leichsenring J; Kreutzfeldt S; Kazdal D; Teleanu V; Endris V; Volckmar A-L; Renner M; Kirchner M; Heilig CE; Neumann O; Schirmacher P; Fröhling S; Stenzinger A (2021). In Der Pathologe 42 (6). DOI: 10.1007/s00292-021-01002-y.
Targeting rare and non-canonical driver variants in NSCLC - An uncharted clinical field. Volckmar A-L; Christopoulos P; Kirchner M; Allgäuer M; Neumann O; Budczies J; Rempel E; Horak P; Glade J; Goldschmid H; Seker-Cin H; Brandt R; Kriegsmann M; Leichsenring J; Winter H; Faehling M; Fischer JR; Heußel CP; Herth F; Brummer T; Fröhling S; Schirmacher P; Thomas M; Endris V; Penzel R; Kazdal D; Bochtler T; Stenzinger A (2021). In Lung cancer (Amsterdam, Netherlands) 154. DOI: 10.1016/j.lungcan.2021.02.022.
Integrating proteomics into precision oncology. Wahjudi LW; Bernhardt S; Abnaof K; Horak P; Kreutzfeldt S; Heining C; Borgoni S; Becki C; Berg D; Richter D; Hutter B; Uhrig S; Pfütze K; Leichsenring J; Glimm H; Brors B; Kalle C von; Stenzinger A; Korf U; Fröhling S; Wiemann S (2021). In International journal of cancer 148 (6). DOI: 10.1002/ijc.33301.